c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\sklearn\utils\deprecation.py:144: FutureWarning: The sklearn.utils.testing module is  deprecated in version 0.22 and will be removed in version 0.24. The corresponding classes / functions should instead be imported from sklearn.utils. Anything that cannot be imported from sklearn.utils is now part of the private API.
  warnings.warn(message, FutureWarning)

Main Datasets (w/ hospitalised data)

Source: https://covidtracking.com/ Source: https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19 Various state data, third party data, and various federal data

Combine, validate, and verify data sets.

# see what filtered main dataframe looks like for all 50 states: 
all_cases.head(50)

#Add state level data, beds, beds/1k, population, abbreviation, and name:
all_cases.head(50)

Load and clean JHU data
Merge JHU dataset with main dataset

#Load the Johns Hopkins data
jhu_df.tail(50)

#Grab all historical data and ensure we have the 1st US case.
all_cases.tail()

An Exploratory data analysis of the US dataset

Basic triad of the dataset: validating data types and data integrity of each row

<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
Int64Index: 6034 entries, 0 to 6033
Data columns (total 29 columns):
date                      6034 non-null datetime64[ns]
state                     6034 non-null object
abbrev                    6034 non-null object
population                6034 non-null int64
positive                  6034 non-null float64
active                    6034 non-null float64
hospitalizedCurrently     3739 non-null float64
hospitalizedCumulative    3306 non-null float64
inIcuCurrently            1933 non-null float64
onVentilatorCurrently     1720 non-null float64
recovered                 6034 non-null float64
dataQualityGrade          5100 non-null object
lastUpdateEt              5679 non-null object
dateModified              5679 non-null object
checkTimeEt               5679 non-null object
death                     6034 non-null float64
hospitalized              3306 non-null float64
totalTestsViral           1640 non-null float64
positiveTestsViral        555 non-null float64
negativeTestsViral        557 non-null float64
positiveCasesViral        3206 non-null float64
commercialScore           6034 non-null int64
negativeRegularScore      6034 non-null int64
negativeScore             6034 non-null int64
positiveScore             6034 non-null int64
score                     6034 non-null int64
grade                     0 non-null float64
bedsPerThousand           6034 non-null float64
total_beds                6034 non-null float64
dtypes: datetime64[ns](1), float64(16), int64(6), object(6)
memory usage: 1.4+ MB

#We check the data type are correct above and review our combined, cleaned, validated, and merged data set for all 50 states:
covid_df.head(50)

The NaN values may indicate that there were no to few Covid-19 patients at these date points. We further analyse the statistical values of the dataset columns to ensure data integrity and accuracy.

#Validte the data with; mean, standard deviation, min/max quartiles:
covid_df.describe()
# TODO rounding up the numbers

#final_100k_last_month.head()

#Review the out for per capita measures:
final_100k_last_month.describe()

Graphical Exploratory Analysis

Plotting histograms, scatterplots and boxplots to assess the distribution of the entire US dataset.

#Validate all US data:
timeseries_usa_df.tail()

Analysis of Hospitalizations by State

New York

C:\Users\Doctor Gomez\AppData\Roaming\Python\Python37\site-packages\pandas\plotting\_converter.py:129: FutureWarning:

Using an implicitly registered datetime converter for a matplotlib plotting method. The converter was registered by pandas on import. Future versions of pandas will require you to explicitly register matplotlib converters.

To register the converters:
	>>> from pandas.plotting import register_matplotlib_converters
	>>> register_matplotlib_converters()

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Alabama

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Arizona

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, '% Positive Cases in Hospital')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Arkansas

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

California

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Colorado

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Connecticut

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Delaware

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Florida

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

# TODO fix legend/axis/plot alltogether
# Timeseries plt
fig, ax = plt.subplots(figsize = (16, 12))
plt.plot(fl.date, fl.positiveTestsViral, linewidth=4.7, color='r')
plt.title('Cummulative Number of Positive Viral Tests in Florida', fontsize=23)
plt.xlabel('Date')
plt.ylabel('No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, '% Infected')

Georgia

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, '% Infection Rate')

Hawaii

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Text(0, 0.5, '% Infected')

Idaho

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Iowa

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Kansas

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Kentucky

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Louisiana

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Maine

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Maryland

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Massachusetts

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Michigan

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Minnesota

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Mississippi

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Missouri

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Montana

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Nebraska

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Nevada:

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

New Hampshire

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

New Jersey

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

New Mexico

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

North Carolina

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Ohio

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Oregon

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Patients')

Text(0, 0.5, 'No. Killed')

Alabama

South Carolina:

Texas:

Mississippi:

Utah:

Oklahoma:

Assessing Correlation of Independent Variables

Build model for dependent Variable

To be used to predict current hospitalizations
Having more complete variables for in ICU currently and on Ventilator Currently will allow us to predict these numbers as well.

	date	state	positive	active	hospitalizedCurrently	hospitalizedCumulative	inIcuCurrently	onVentilatorCurrently	recovered	dataQualityGrade	...	totalTestsViral	positiveTestsViral	negativeTestsViral	positiveCasesViral	grade
0	2020-06-30	AK	940.0	400.0	18.0	NaN	NaN	1.0	526.0	A	...	112185.0	NaN	NaN	NaN	NaN
1	2020-06-30	AL	38045.0	18229.0	776.0	2769.0	NaN	NaN	18866.0	B	...	NaN	NaN	NaN	37536.0	NaN
2	2020-06-30	AR	20777.0	5976.0	290.0	1413.0	NaN	67.0	14531.0	A	...	NaN	NaN	NaN	20777.0	NaN
4	2020-06-30	AZ	79215.0	68172.0	2793.0	4736.0	683.0	455.0	9411.0	A+	...	531922.0	NaN	NaN	78781.0	NaN
5	2020-06-30	CA	222917.0	NaN	6466.0	NaN	1751.0	NaN	NaN	B	...	4167139.0	NaN	NaN	222917.0	NaN
6	2020-06-30	CO	32511.0	26350.0	271.0	5442.0	NaN	NaN	4479.0	A	...	NaN	NaN	NaN	29651.0	NaN
7	2020-06-30	CT	46514.0	34139.0	98.0	10268.0	NaN	NaN	8053.0	B	...	464414.0	NaN	NaN	44534.0	NaN
8	2020-06-30	DC	10327.0	8506.0	126.0	NaN	33.0	22.0	1270.0	A+	...	NaN	NaN	NaN	10327.0	NaN
9	2020-06-30	DE	11474.0	4298.0	64.0	NaN	13.0	NaN	6667.0	A+	...	NaN	NaN	NaN	10430.0	NaN
10	2020-06-30	FL	152434.0	NaN	NaN	14879.0	NaN	NaN	NaN	A	...	2337165.0	195894.0	2136944.0	152434.0	NaN
11	2020-06-30	GA	81291.0	NaN	1459.0	11051.0	NaN	NaN	NaN	A	...	833878.0	74214.0	759664.0	81291.0	NaN
13	2020-06-30	HI	900.0	160.0	NaN	111.0	NaN	NaN	722.0	D	...	90577.0	900.0	89677.0	900.0	NaN
14	2020-06-30	IA	29007.0	5080.0	133.0	NaN	34.0	20.0	23212.0	A+	...	NaN	NaN	NaN	29007.0	NaN
15	2020-06-30	ID	5752.0	1588.0	NaN	322.0	NaN	NaN	4073.0	A	...	88763.0	NaN	NaN	5212.0	NaN
16	2020-06-30	IL	144238.0	NaN	1560.0	NaN	401.0	185.0	NaN	A	...	1602965.0	NaN	NaN	143185.0	NaN
17	2020-06-30	IN	45594.0	8308.0	695.0	7065.0	272.0	97.0	34646.0	A+	...	NaN	NaN	NaN	45594.0	NaN
18	2020-06-30	KS	14443.0	13379.0	NaN	1152.0	NaN	NaN	794.0	A	...	NaN	NaN	NaN	14443.0	NaN
19	2020-06-30	KY	15624.0	11069.0	408.0	2621.0	75.0	NaN	3990.0	B	...	NaN	NaN	NaN	15090.0	NaN
20	2020-06-30	LA	58095.0	12649.0	781.0	NaN	NaN	83.0	42225.0	B	...	NaN	NaN	NaN	58095.0	NaN
21	2020-06-30	MA	108882.0	NaN	733.0	11337.0	120.0	63.0	NaN	A+	...	1066060.0	NaN	NaN	103701.0	NaN
22	2020-06-30	MD	67559.0	59387.0	452.0	10844.0	152.0	NaN	4982.0	A	...	652701.0	NaN	NaN	67559.0	NaN
23	2020-06-30	ME	3253.0	502.0	29.0	348.0	9.0	4.0	2646.0	A	...	94592.0	3924.0	90532.0	2893.0	NaN
24	2020-06-30	MI	70728.0	13436.0	471.0	NaN	179.0	98.0	51099.0	A+	...	1062116.0	87787.0	974329.0	63870.0	NaN
25	2020-06-30	MN	36303.0	3226.0	270.0	4054.0	136.0	NaN	31601.0	A	...	605316.0	NaN	NaN	36303.0	NaN
26	2020-06-30	MO	21551.0	NaN	599.0	NaN	NaN	66.0	NaN	B	...	424214.0	23527.0	399926.0	21551.0	NaN
28	2020-06-30	MS	27247.0	6786.0	779.0	3156.0	167.0	91.0	19388.0	A	...	299511.0	NaN	NaN	27067.0	NaN
29	2020-06-30	MT	967.0	303.0	12.0	101.0	NaN	NaN	642.0	C	...	NaN	NaN	NaN	967.0	NaN
30	2020-06-30	NC	64670.0	17789.0	908.0	NaN	NaN	NaN	45538.0	A	...	NaN	NaN	NaN	64670.0	NaN
31	2020-06-30	ND	3576.0	293.0	25.0	231.0	NaN	NaN	3195.0	D	...	182283.0	NaN	NaN	3576.0	NaN
32	2020-06-30	NE	19042.0	5226.0	121.0	1330.0	NaN	NaN	13547.0	B	...	NaN	NaN	NaN	19042.0	NaN
33	2020-06-30	NH	5760.0	958.0	34.0	565.0	NaN	NaN	4435.0	B	...	NaN	NaN	NaN	5760.0	NaN
34	2020-06-30	NJ	171667.0	126419.0	992.0	19847.0	211.0	174.0	30213.0	A+	...	NaN	NaN	NaN	171667.0	NaN
35	2020-06-30	NM	11982.0	6193.0	119.0	1876.0	NaN	NaN	5296.0	B	...	NaN	NaN	NaN	11982.0	NaN
36	2020-06-30	NV	18456.0	17260.0	593.0	NaN	134.0	65.0	689.0	A+	...	322944.0	NaN	NaN	18456.0	NaN
37	2020-06-30	NY	393454.0	298112.0	891.0	89995.0	217.0	137.0	70487.0	A	...	NaN	NaN	NaN	393454.0	NaN
38	2020-06-30	OH	51789.0	NaN	722.0	7839.0	242.0	115.0	NaN	B	...	NaN	NaN	NaN	48222.0	NaN
39	2020-06-30	OK	13757.0	3285.0	315.0	1520.0	111.0	NaN	10085.0	A+	...	343623.0	15029.0	327840.0	13757.0	NaN
40	2020-06-30	OR	8656.0	5727.0	149.0	1038.0	42.0	25.0	2722.0	A+	...	NaN	NaN	228978.0	8265.0	NaN
41	2020-06-30	PA	86606.0	12405.0	634.0	NaN	NaN	110.0	67552.0	A+	...	NaN	NaN	NaN	84130.0	NaN
43	2020-06-30	RI	16813.0	14232.0	74.0	2001.0	13.0	13.0	1631.0	A+	...	NaN	NaN	NaN	16813.0	NaN
44	2020-06-30	SC	36399.0	20189.0	1021.0	2854.0	NaN	NaN	15471.0	A	...	380470.0	46401.0	334069.0	36297.0	NaN
45	2020-06-30	SD	6764.0	801.0	62.0	666.0	NaN	NaN	5872.0	B	...	NaN	NaN	NaN	6764.0	NaN
46	2020-06-30	TN	43509.0	15306.0	527.0	2665.0	NaN	NaN	27599.0	B	...	792779.0	50413.0	742366.0	43161.0	NaN
47	2020-06-30	TX	159986.0	72744.0	6533.0	NaN	NaN	NaN	84818.0	B	...	1869282.0	NaN	NaN	NaN	NaN
48	2020-06-30	UT	22217.0	9647.0	250.0	1444.0	83.0	NaN	12398.0	A+	...	NaN	NaN	NaN	22217.0	NaN
49	2020-06-30	VA	62787.0	52944.0	902.0	8982.0	230.0	98.0	8080.0	A+	...	642371.0	NaN	NaN	60124.0	NaN
51	2020-06-30	VT	1208.0	199.0	16.0	NaN	NaN	NaN	953.0	B	...	NaN	NaN	NaN	1208.0	NaN
52	2020-06-30	WA	32253.0	NaN	282.0	4323.0	NaN	50.0	NaN	B	...	NaN	NaN	NaN	32253.0	NaN
53	2020-06-30	WI	31662.0	8291.0	242.0	3446.0	79.0	NaN	22587.0	A+	...	NaN	NaN	NaN	28659.0	NaN
54	2020-06-30	WV	2905.0	540.0	27.0	NaN	10.0	3.0	2272.0	B	...	NaN	NaN	NaN	2804.0	NaN

	date	state	abbrev	population	positive	active	hospitalizedCurrently	hospitalizedCumulative	inIcuCurrently	onVentilatorCurrently	...	negativeTestsViral	positiveCasesViral	grade	bedsPerThousand	total_beds
0	2020-06-30	Alaska	AK	734002	940.0	400.0	18.0	NaN	NaN	1.0	...	NaN	NaN	NaN	2.2	1614.8044
1	2020-06-30	Alabama	AL	4908621	38045.0	18229.0	776.0	2769.0	NaN	NaN	...	NaN	37536.0	NaN	3.1	15216.7251
2	2020-06-30	Arkansas	AR	3038999	20777.0	5976.0	290.0	1413.0	NaN	67.0	...	NaN	20777.0	NaN	3.2	9724.7968
3	2020-06-30	Arizona	AZ	7378494	79215.0	68172.0	2793.0	4736.0	683.0	455.0	...	NaN	78781.0	NaN	1.9	14019.1386
4	2020-06-30	California	CA	39937489	222917.0	NaN	6466.0	NaN	1751.0	NaN	...	NaN	222917.0	NaN	1.8	71887.4802
5	2020-06-30	Colorado	CO	5845526	32511.0	26350.0	271.0	5442.0	NaN	NaN	...	NaN	29651.0	NaN	1.9	11106.4994
6	2020-06-30	Connecticut	CT	3563077	46514.0	34139.0	98.0	10268.0	NaN	NaN	...	NaN	44534.0	NaN	2.0	7126.1540
7	2020-06-30	District of Columbia	DC	720687	10327.0	8506.0	126.0	NaN	33.0	22.0	...	NaN	10327.0	NaN	4.4	3171.0228
8	2020-06-30	Delaware	DE	982895	11474.0	4298.0	64.0	NaN	13.0	NaN	...	NaN	10430.0	NaN	2.2	2162.3690
9	2020-06-30	Florida	FL	21992985	152434.0	NaN	NaN	14879.0	NaN	NaN	...	2136944.0	152434.0	NaN	2.6	57181.7610
10	2020-06-30	Georgia	GA	10736059	81291.0	NaN	1459.0	11051.0	NaN	NaN	...	759664.0	81291.0	NaN	2.4	25766.5416
11	2020-06-30	Hawaii	HI	1412687	900.0	160.0	NaN	111.0	NaN	NaN	...	89677.0	900.0	NaN	1.9	2684.1053
12	2020-06-30	Iowa	IA	3179849	29007.0	5080.0	133.0	NaN	34.0	20.0	...	NaN	29007.0	NaN	3.0	9539.5470
13	2020-06-30	Idaho	ID	1826156	5752.0	1588.0	NaN	322.0	NaN	NaN	...	NaN	5212.0	NaN	1.9	3469.6964
14	2020-06-30	Illinois	IL	12659682	144238.0	NaN	1560.0	NaN	401.0	185.0	...	NaN	143185.0	NaN	2.5	31649.2050
15	2020-06-30	Indiana	IN	6745354	45594.0	8308.0	695.0	7065.0	272.0	97.0	...	NaN	45594.0	NaN	2.7	18212.4558
16	2020-06-30	Kansas	KS	2910357	14443.0	13379.0	NaN	1152.0	NaN	NaN	...	NaN	14443.0	NaN	3.3	9604.1781
17	2020-06-30	Kentucky	KY	4499692	15624.0	11069.0	408.0	2621.0	75.0	NaN	...	NaN	15090.0	NaN	3.2	14399.0144
18	2020-06-30	Louisiana	LA	4645184	58095.0	12649.0	781.0	NaN	NaN	83.0	...	NaN	58095.0	NaN	3.3	15329.1072
19	2020-06-30	Massachusetts	MA	6976597	108882.0	NaN	733.0	11337.0	120.0	63.0	...	NaN	103701.0	NaN	2.3	16046.1731
20	2020-06-30	Maryland	MD	6083116	67559.0	59387.0	452.0	10844.0	152.0	NaN	...	NaN	67559.0	NaN	1.9	11557.9204
21	2020-06-30	Maine	ME	1345790	3253.0	502.0	29.0	348.0	9.0	4.0	...	90532.0	2893.0	NaN	2.5	3364.4750
22	2020-06-30	Michigan	MI	10045029	70728.0	13436.0	471.0	NaN	179.0	98.0	...	974329.0	63870.0	NaN	2.5	25112.5725
23	2020-06-30	Minnesota	MN	5700671	36303.0	3226.0	270.0	4054.0	136.0	NaN	...	NaN	36303.0	NaN	2.5	14251.6775
24	2020-06-30	Missouri	MO	6169270	21551.0	NaN	599.0	NaN	NaN	66.0	...	399926.0	21551.0	NaN	3.1	19124.7370
25	2020-06-30	Mississippi	MS	2989260	27247.0	6786.0	779.0	3156.0	167.0	91.0	...	NaN	27067.0	NaN	4.0	11957.0400
26	2020-06-30	Montana	MT	1086759	967.0	303.0	12.0	101.0	NaN	NaN	...	NaN	967.0	NaN	3.3	3586.3047
27	2020-06-30	North Carolina	NC	10611862	64670.0	17789.0	908.0	NaN	NaN	NaN	...	NaN	64670.0	NaN	2.1	22284.9102
28	2020-06-30	North Dakota	ND	761723	3576.0	293.0	25.0	231.0	NaN	NaN	...	NaN	3576.0	NaN	4.3	3275.4089
29	2020-06-30	Nebraska	NE	1952570	19042.0	5226.0	121.0	1330.0	NaN	NaN	...	NaN	19042.0	NaN	3.6	7029.2520
30	2020-06-30	New Hampshire	NH	1371246	5760.0	958.0	34.0	565.0	NaN	NaN	...	NaN	5760.0	NaN	2.1	2879.6166
31	2020-06-30	New Jersey	NJ	8936574	171667.0	126419.0	992.0	19847.0	211.0	174.0	...	NaN	171667.0	NaN	2.4	21447.7776
32	2020-06-30	New Mexico	NM	2096640	11982.0	6193.0	119.0	1876.0	NaN	NaN	...	NaN	11982.0	NaN	1.8	3773.9520
33	2020-06-30	Nevada	NV	3139658	18456.0	17260.0	593.0	NaN	134.0	65.0	...	NaN	18456.0	NaN	2.1	6593.2818
34	2020-06-30	New York	NY	19440469	393454.0	298112.0	891.0	89995.0	217.0	137.0	...	NaN	393454.0	NaN	2.7	52489.2663
35	2020-06-30	Ohio	OH	11747694	51789.0	NaN	722.0	7839.0	242.0	115.0	...	NaN	48222.0	NaN	2.8	32893.5432
36	2020-06-30	Oklahoma	OK	3954821	13757.0	3285.0	315.0	1520.0	111.0	NaN	...	327840.0	13757.0	NaN	2.8	11073.4988
37	2020-06-30	Oregon	OR	4301089	8656.0	5727.0	149.0	1038.0	42.0	25.0	...	228978.0	8265.0	NaN	1.6	6881.7424
38	2020-06-30	Pennsylvania	PA	12820878	86606.0	12405.0	634.0	NaN	NaN	110.0	...	NaN	84130.0	NaN	2.9	37180.5462
39	2020-06-30	Rhode Island	RI	1056161	16813.0	14232.0	74.0	2001.0	13.0	13.0	...	NaN	16813.0	NaN	2.1	2217.9381
40	2020-06-30	South Carolina	SC	5210095	36399.0	20189.0	1021.0	2854.0	NaN	NaN	...	334069.0	36297.0	NaN	2.4	12504.2280
41	2020-06-30	South Dakota	SD	903027	6764.0	801.0	62.0	666.0	NaN	NaN	...	NaN	6764.0	NaN	4.8	4334.5296
42	2020-06-30	Tennessee	TN	6897576	43509.0	15306.0	527.0	2665.0	NaN	NaN	...	742366.0	43161.0	NaN	2.9	20002.9704
43	2020-06-30	Texas	TX	29472295	159986.0	72744.0	6533.0	NaN	NaN	NaN	...	NaN	NaN	NaN	2.3	67786.2785
44	2020-06-30	Utah	UT	3282115	22217.0	9647.0	250.0	1444.0	83.0	NaN	...	NaN	22217.0	NaN	1.8	5907.8070
45	2020-06-30	Virginia	VA	8626207	62787.0	52944.0	902.0	8982.0	230.0	98.0	...	NaN	60124.0	NaN	2.1	18115.0347
46	2020-06-30	Vermont	VT	628061	1208.0	199.0	16.0	NaN	NaN	NaN	...	NaN	1208.0	NaN	2.1	1318.9281
47	2020-06-30	Washington	WA	7797095	32253.0	NaN	282.0	4323.0	NaN	50.0	...	NaN	32253.0	NaN	1.7	13255.0615
48	2020-06-30	Wisconsin	WI	5851754	31662.0	8291.0	242.0	3446.0	79.0	NaN	...	NaN	28659.0	NaN	2.1	12288.6834
49	2020-06-30	West Virginia	WV	1778070	2905.0	540.0	27.0	NaN	10.0	3.0	...	NaN	2804.0	NaN	3.8	6756.6660

	LastUpdate	ProvinceState	Active	Confirmed	Deaths
5145	2020-06-19	Alaska	695.0	707.0	12.0
5146	2020-06-19	Arizona	42162.0	43445.0	1283.0
5147	2020-06-19	Arkansas	13720.0	13928.0	208.0
5148	2020-06-19	California	161731.0	167086.0	5355.0
5149	2020-06-19	Colorado	28248.0	29886.0	1638.0
5150	2020-06-19	Connecticut	41214.0	45440.0	4226.0
5151	2020-06-19	Delaware	10068.0	10499.0	431.0
5152	2020-06-19	District of Columbia	9376.0	9903.0	527.0
5153	2020-06-19	Florida	82865.0	85926.0	3061.0
5154	2020-06-19	Georgia	58307.0	60912.0	2605.0
5155	2020-06-19	Hawaii	745.0	762.0	17.0
5156	2020-06-19	Idaho	3654.0	3743.0	89.0
5157	2020-06-19	Illinois	128241.0	134778.0	6537.0
5158	2020-06-19	Indiana	38947.0	41438.0	2491.0
5159	2020-06-19	Iowa	24181.0	24861.0	680.0
5160	2020-06-19	Kansas	11502.0	11753.0	251.0
5161	2020-06-19	Kentucky	12677.0	13197.0	520.0
5162	2020-06-19	Louisiana	45572.0	48634.0	3062.0
5163	2020-06-19	Maine	2776.0	2878.0	102.0
5164	2020-06-19	Maryland	60213.0	63229.0	3016.0
5165	2020-06-19	Massachusetts	98653.0	106422.0	7769.0
5166	2020-06-19	Michigan	60737.0	66798.0	6061.0
5167	2020-06-19	Minnesota	30299.0	31675.0	1376.0
5168	2020-06-19	Mississippi	19703.0	20641.0	938.0
5169	2020-06-19	Missouri	16426.0	17371.0	945.0
5170	2020-06-19	Montana	635.0	655.0	20.0
5171	2020-06-19	Nebraska	17175.0	17414.0	239.0
5172	2020-06-19	Nevada	11694.0	12169.0	475.0
5173	2020-06-19	New Hampshire	5119.0	5450.0	331.0
5174	2020-06-19	New Jersey	155238.0	168107.0	12869.0
5175	2020-06-19	New Mexico	9697.0	10153.0	456.0
5176	2020-06-19	New York	354786.0	385760.0	30974.0
5177	2020-06-19	North Carolina	46972.0	48168.0	1196.0
5178	2020-06-19	North Dakota	3118.0	3193.0	75.0
5179	2020-06-19	Ohio	40489.0	43122.0	2633.0
5180	2020-06-19	Oklahoma	8989.0	9355.0	366.0
5181	2020-06-19	Oregon	6179.0	6366.0	187.0
5182	2020-06-19	Pennsylvania	78322.0	84683.0	6361.0
5183	2020-06-19	Rhode Island	15384.0	16269.0	885.0
5184	2020-06-19	South Carolina	20912.0	21533.0	621.0
5185	2020-06-19	South Dakota	6031.0	6109.0	78.0
5186	2020-06-19	Tennessee	32262.0	32770.0	508.0
5187	2020-06-19	Texas	99130.0	101259.0	2129.0
5188	2020-06-19	Utah	15687.0	15839.0	152.0
5189	2020-06-19	Vermont	1079.0	1135.0	56.0
5190	2020-06-19	Virginia	54652.0	56238.0	1586.0
5191	2020-06-19	Washington	25947.0	27192.0	1245.0
5192	2020-06-19	West Virginia	2330.0	2418.0	88.0
5193	2020-06-19	Wisconsin	23157.0	23876.0	719.0
5194	2020-06-19	Wyoming	1126.0	1144.0	18.0

	date	state	abbrev	population	positive	active	hospitalizedCurrently	hospitalizedCumulative	inIcuCurrently	onVentilatorCurrently	...	negativeTestsViral	positiveCasesViral	grade	bedsPerThousand	total_beds
0	2020-06-30	Alaska	AK	734002	940.000	400.000	18.000	nan	nan	1.000	...	nan	nan	nan	2.200	1614.804
1	2020-06-30	Alabama	AL	4908621	38045.000	18229.000	776.000	2769.000	nan	nan	...	nan	37536.000	nan	3.100	15216.725
2	2020-06-30	Arkansas	AR	3038999	20777.000	5976.000	290.000	1413.000	nan	67.000	...	nan	20777.000	nan	3.200	9724.797
3	2020-06-30	Arizona	AZ	7378494	79215.000	68172.000	2793.000	4736.000	683.000	455.000	...	nan	78781.000	nan	1.900	14019.139
4	2020-06-30	California	CA	39937489	222917.000	216937.000	6466.000	nan	1751.000	nan	...	nan	222917.000	nan	1.800	71887.480
5	2020-06-30	Colorado	CO	5845526	32511.000	26350.000	271.000	5442.000	nan	nan	...	nan	29651.000	nan	1.900	11106.499
6	2020-06-30	Connecticut	CT	3563077	46514.000	34139.000	98.000	10268.000	nan	nan	...	nan	44534.000	nan	2.000	7126.154
7	2020-06-30	District of Columbia	DC	720687	10327.000	8506.000	126.000	nan	33.000	22.000	...	nan	10327.000	nan	4.400	3171.023
8	2020-06-30	Delaware	DE	982895	11474.000	4298.000	64.000	nan	13.000	nan	...	nan	10430.000	nan	2.200	2162.369
9	2020-06-30	Florida	FL	21992985	152434.000	148830.000	nan	14879.000	nan	nan	...	2136944.000	152434.000	nan	2.600	57181.761
10	2020-06-30	Georgia	GA	10736059	81291.000	78486.000	1459.000	11051.000	nan	nan	...	759664.000	81291.000	nan	2.400	25766.542
11	2020-06-30	Hawaii	HI	1412687	900.000	160.000	nan	111.000	nan	nan	...	89677.000	900.000	nan	1.900	2684.105
12	2020-06-30	Iowa	IA	3179849	29007.000	5080.000	133.000	nan	34.000	20.000	...	nan	29007.000	nan	3.000	9539.547
13	2020-06-30	Idaho	ID	1826156	5752.000	1588.000	nan	322.000	nan	nan	...	nan	5212.000	nan	1.900	3469.696
14	2020-06-30	Illinois	IL	12659682	144238.000	137114.000	1560.000	nan	401.000	185.000	...	nan	143185.000	nan	2.500	31649.205
15	2020-06-30	Indiana	IN	6745354	45594.000	8308.000	695.000	7065.000	272.000	97.000	...	nan	45594.000	nan	2.700	18212.456
16	2020-06-30	Kansas	KS	2910357	14443.000	13379.000	nan	1152.000	nan	nan	...	nan	14443.000	nan	3.300	9604.178
17	2020-06-30	Kentucky	KY	4499692	15624.000	11069.000	408.000	2621.000	75.000	nan	...	nan	15090.000	nan	3.200	14399.014
18	2020-06-30	Louisiana	LA	4645184	58095.000	12649.000	781.000	nan	nan	83.000	...	nan	58095.000	nan	3.300	15329.107
19	2020-06-30	Massachusetts	MA	6976597	108882.000	100828.000	733.000	11337.000	120.000	63.000	...	nan	103701.000	nan	2.300	16046.173
20	2020-06-30	Maryland	MD	6083116	67559.000	59387.000	452.000	10844.000	152.000	nan	...	nan	67559.000	nan	1.900	11557.920
21	2020-06-30	Maine	ME	1345790	3253.000	502.000	29.000	348.000	9.000	4.000	...	90532.000	2893.000	nan	2.500	3364.475
22	2020-06-30	Michigan	MI	10045029	70728.000	13436.000	471.000	nan	179.000	98.000	...	974329.000	63870.000	nan	2.500	25112.572
23	2020-06-30	Minnesota	MN	5700671	36303.000	3226.000	270.000	4054.000	136.000	nan	...	nan	36303.000	nan	2.500	14251.678
24	2020-06-30	Missouri	MO	6169270	21551.000	20536.000	599.000	nan	nan	66.000	...	399926.000	21551.000	nan	3.100	19124.737
25	2020-06-30	Mississippi	MS	2989260	27247.000	6786.000	779.000	3156.000	167.000	91.000	...	nan	27067.000	nan	4.000	11957.040
26	2020-06-30	Montana	MT	1086759	967.000	303.000	12.000	101.000	nan	nan	...	nan	967.000	nan	3.300	3586.305
27	2020-06-30	North Carolina	NC	10611862	64670.000	17789.000	908.000	nan	nan	nan	...	nan	64670.000	nan	2.100	22284.910
28	2020-06-30	North Dakota	ND	761723	3576.000	293.000	25.000	231.000	nan	nan	...	nan	3576.000	nan	4.300	3275.409
29	2020-06-30	Nebraska	NE	1952570	19042.000	5226.000	121.000	1330.000	nan	nan	...	nan	19042.000	nan	3.600	7029.252
30	2020-06-30	New Hampshire	NH	1371246	5760.000	958.000	34.000	565.000	nan	nan	...	nan	5760.000	nan	2.100	2879.617
31	2020-06-30	New Jersey	NJ	8936574	171667.000	126419.000	992.000	19847.000	211.000	174.000	...	nan	171667.000	nan	2.400	21447.778
32	2020-06-30	New Mexico	NM	2096640	11982.000	6193.000	119.000	1876.000	nan	nan	...	nan	11982.000	nan	1.800	3773.952
33	2020-06-30	Nevada	NV	3139658	18456.000	17260.000	593.000	nan	134.000	65.000	...	nan	18456.000	nan	2.100	6593.282
34	2020-06-30	New York	NY	19440469	393454.000	298112.000	891.000	89995.000	217.000	137.000	...	nan	393454.000	nan	2.700	52489.266
35	2020-06-30	Ohio	OH	11747694	51789.000	48926.000	722.000	7839.000	242.000	115.000	...	nan	48222.000	nan	2.800	32893.543
36	2020-06-30	Oklahoma	OK	3954821	13757.000	3285.000	315.000	1520.000	111.000	nan	...	327840.000	13757.000	nan	2.800	11073.499
37	2020-06-30	Oregon	OR	4301089	8656.000	5727.000	149.000	1038.000	42.000	25.000	...	228978.000	8265.000	nan	1.600	6881.742
38	2020-06-30	Pennsylvania	PA	12820878	86606.000	12405.000	634.000	nan	nan	110.000	...	nan	84130.000	nan	2.900	37180.546
39	2020-06-30	Rhode Island	RI	1056161	16813.000	14232.000	74.000	2001.000	13.000	13.000	...	nan	16813.000	nan	2.100	2217.938
40	2020-06-30	South Carolina	SC	5210095	36399.000	20189.000	1021.000	2854.000	nan	nan	...	334069.000	36297.000	nan	2.400	12504.228
41	2020-06-30	South Dakota	SD	903027	6764.000	801.000	62.000	666.000	nan	nan	...	nan	6764.000	nan	4.800	4334.530
42	2020-06-30	Tennessee	TN	6897576	43509.000	15306.000	527.000	2665.000	nan	nan	...	742366.000	43161.000	nan	2.900	20002.970
43	2020-06-30	Texas	TX	29472295	159986.000	72744.000	6533.000	nan	nan	nan	...	nan	nan	nan	2.300	67786.278
44	2020-06-30	Utah	UT	3282115	22217.000	9647.000	250.000	1444.000	83.000	nan	...	nan	22217.000	nan	1.800	5907.807
45	2020-06-30	Virginia	VA	8626207	62787.000	52944.000	902.000	8982.000	230.000	98.000	...	nan	60124.000	nan	2.100	18115.035
46	2020-06-30	Vermont	VT	628061	1208.000	199.000	16.000	nan	nan	nan	...	nan	1208.000	nan	2.100	1318.928
47	2020-06-30	Washington	WA	7797095	32253.000	30933.000	282.000	4323.000	nan	50.000	...	nan	32253.000	nan	1.700	13255.061
48	2020-06-30	Wisconsin	WI	5851754	31662.000	8291.000	242.000	3446.000	79.000	nan	...	nan	28659.000	nan	2.100	12288.683
49	2020-06-30	West Virginia	WV	1778070	2905.000	540.000	27.000	nan	10.000	3.000	...	nan	2804.000	nan	3.800	6756.666

	population	positive	active	hospitalizedCurrently	hospitalizedCumulative	inIcuCurrently	onVentilatorCurrently	recovered	death	hospitalized	...	negativeTestsViral	positiveCasesViral	commercialScore	negativeRegularScore	negativeScore	positiveScore	score	grade	bedsPerThousand	total_beds
count	6034.000	6034.000	6034.000	3739.000	3306.000	1933.000	1720.000	6034.000	6034.000	3306.000	...	557.000	3206.000	6034.000	6034.000	6034.000	6034.000	6034.000	0.000	6034.000	6034.000
mean	6542177.949	21664.959	19012.828	1016.199	4420.804	435.195	221.276	4634.585	1122.867	4420.804	...	304052.707	32743.682	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	nan	2.626	15805.406
std	7386887.293	47418.576	42396.431	1914.007	12997.569	686.535	325.642	11309.159	2952.200	12997.569	...	401425.780	57145.293	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	nan	0.744	16159.400
min	567025.000	0.000	0.000	1.000	0.000	2.000	0.000	0.000	0.000	0.000	...	17.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	nan	1.600	1318.928
25%	1778070.000	654.250	565.500	119.000	225.250	81.000	35.000	0.000	13.000	225.250	...	50591.000	5129.750	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	nan	2.100	3773.952
50%	4499692.000	5309.000	4671.000	402.000	997.000	179.000	93.000	255.500	152.500	997.000	...	148910.000	14087.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	nan	2.500	11557.920
75%	7797095.000	21609.000	17784.750	1009.500	3335.500	472.000	244.000	3252.000	806.750	3335.500	...	399926.000	36296.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	nan	3.100	19124.737
max	39937489.000	393454.000	356899.000	18825.000	89995.000	5225.000	2425.000	84818.000	24855.000	89995.000	...	2136944.000	393454.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	nan	4.800	71887.480

	date	state	abbrev	population	positive	active	hospitalizedCurrently	hospitalizedCumulative	inIcuCurrently	onVentilatorCurrently	...	negativeTestsViral	positiveCasesViral	grade	bedsPerThousand	total_beds
6029	2020-01-26	Washington	WA	7797095	2.0	2.0	NaN	NaN	NaN	NaN	...	NaN	NaN	NaN	1.7	13255.0615
6030	2020-01-25	Washington	WA	7797095	2.0	2.0	NaN	NaN	NaN	NaN	...	NaN	NaN	NaN	1.7	13255.0615
6031	2020-01-24	Washington	WA	7797095	2.0	2.0	NaN	NaN	NaN	NaN	...	NaN	NaN	NaN	1.7	13255.0615
6032	2020-01-23	Washington	WA	7797095	2.0	2.0	NaN	NaN	NaN	NaN	...	NaN	NaN	NaN	1.7	13255.0615
6033	2020-01-22	Washington	WA	7797095	2.0	2.0	NaN	NaN	NaN	NaN	...	NaN	NaN	NaN	1.7	13255.0615

	positive_100k	active_100k	recovered_100k	death_100k	hospitalizedCumulative_100k	inIcuCurrently_100k	onVentilatorCurrently_100k	BedsPer100k
count	61.000	61.000	61.000	61.000	61.000	62.000	62.000	62.000
mean	358.759	336.008	170.212	17.931	34.329	113.658	62.620	13440.000
std	65.620	442.921	105.723	7.283	42.821	26.916	13.514	0.000
min	245.203	-2213.482	35.481	4.880	-93.926	70.613	39.353	13440.000
25%	308.315	292.339	107.989	12.184	21.638	94.079	53.461	13440.000
50%	344.558	332.717	147.227	17.253	25.122	111.563	62.120	13440.000
75%	405.031	370.778	211.312	23.811	29.823	126.991	74.683	13440.000
max	544.349	2291.210	626.665	33.917	246.371	167.561	94.521	13440.000

	date	positive_100k	active_100k	recovered_100k	death_100k	hospitalizedCurrently_100k	inIcuCurrently_100k	onVentilatorCurrently_100k	BedsPer100k
156	2020-06-26	34335.924	20098.997	12643.998	1592.929	404.115	67.051	34.318	13440.000
157	2020-06-27	34829.638	20417.559	12812.241	1599.839	407.257	68.533	35.118	13440.000
158	2020-06-28	35334.565	20809.528	12921.408	1603.630	402.011	65.968	33.930	13440.000
159	2020-06-29	35834.140	20955.190	13269.151	1609.799	409.624	66.395	32.901	13440.000
160	2020-06-30	36369.224	21135.140	13616.885	1617.200	423.406	66.047	33.482	13440.000